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    承啟生物承接國際人類蛋白質(zhì)組計劃官方數(shù)據(jù)庫建設(shè)

    深圳2021年12月3日 /美通社/ -- 近日,國際人類蛋白質(zhì)組計劃確定,由承啟生物承接國際人類蛋白質(zhì)組計劃的官方數(shù)據(jù)庫neXtProt(亞洲分站)的建設(shè)。這是國際人類蛋白質(zhì)組計劃第一次將官方數(shù)據(jù)庫交由亞洲公司進行建設(shè),標志著中國在人類蛋白質(zhì)組計劃中的核心地位提升,也顯示出承啟生物不僅僅在測序領(lǐng)域取得國際聲譽,同時在蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域也受到國際學術(shù)界的權(quán)威認可。11月底,承啟與neXtProt數(shù)據(jù)庫工作人員進行視頻連線會議,neXtProt亞洲分站的建設(shè)正式開始。

    承啟團隊與neXtProt工作人員視頻連線會議
    承啟團隊與neXtProt工作人員視頻連線會議

    國際人類蛋白質(zhì)組計劃(Human Proteome Project, HPP)是國際人類基因組計劃(Human Genome Project, HGP)的后續(xù)國際合作項目,最早可追溯至2000年。彼時,人類基因組計劃尚未完成,科學家們就已經(jīng)意識到搞清楚人類基因組并不能完全理解人的生理病理過程,因為一個基因可以變化出幾種至數(shù)千種不同的蛋白質(zhì)形體(proteoform),而蛋白質(zhì)才是各種生理和病理功能的實際執(zhí)行者。因此,各國科學家又策劃了人類蛋白質(zhì)組計劃,力圖研究所有的人類蛋白質(zhì),這樣才能解開生命的奧秘。經(jīng)過12年的前期準備,2012年人類蛋白質(zhì)組計劃正式啟動。

    人類蛋白質(zhì)組計劃的官方數(shù)據(jù)庫是neXtProt (www.nextprot.org),目的是建立一個人類蛋白質(zhì)的百科全書。這個龐大的數(shù)據(jù)庫最初由瑞士生物信息學研究所(Swiss Institute of Bioinformatics) 和GeneBio SA 共同開發(fā),不但存儲了大量的人類蛋白質(zhì)知識庫,也有大量蛋白質(zhì)組、微陣列、RNA、蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-小分子相互作用等高質(zhì)量數(shù)據(jù)集,其上的數(shù)據(jù)頻繁地更新,是人類蛋白質(zhì)研究的集大成者,相當于研究人類蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)設(shè)施。

    neXtProt數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站界面
    neXtProt數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站界面

    隨著人類蛋白質(zhì)研究的不斷深入,neXtProt數(shù)據(jù)庫的容量越來越大,服務器負荷日漸沉重。中國日益增長的科研實力使得中國學者訪問該數(shù)據(jù)庫的需求與日俱增,但現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫的資源卻遠遠不能滿足要求。為了推動人類科學界對人類蛋白質(zhì)組的研究,尋找有實力、有口碑的單位進行合作就成為其最佳選擇。最終,承啟被選定為neXtProt亞洲分站的承建單位。

    雖然承啟的主營業(yè)務主要是與大規(guī)模測序相關(guān),由于其自研的FANSe系列高精度測序比對算法而被業(yè)界熟知,但承啟在蛋白質(zhì)組上的積累很早就開始了。早在2014年,承啟首席科學家張弓教授所建立的翻譯組測序技術(shù)就被作為人類蛋白質(zhì)組計劃的核心支柱之一,并連續(xù)被HUPO(人類蛋白質(zhì)組組織)邀請在HUPO大會上做演講。2017年,承啟在HUPO大會上宣布免費為人類蛋白質(zhì)組計劃提供翻譯組測序服務。2018年,承啟發(fā)布了當時世界上最強的翻譯組學數(shù)據(jù)庫,為蛋白質(zhì)組研究提供了重要的參考,該數(shù)據(jù)庫被發(fā)表在國際權(quán)威期刊Nucleic Acids Research上。2019年,張弓教授發(fā)表重大成果,通過翻譯組測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個原本認為不可能編碼蛋白質(zhì)的“非編碼基因”實際上能翻譯出50個氨基酸以上的蛋白質(zhì),并且這些蛋白質(zhì)穩(wěn)定存在,在癌癥中發(fā)揮著重要作用,人類基因組需要被系統(tǒng)性地重新注釋。承啟在這一研究中提供了核心的生物信息學分析服務。因此承啟被委以此重任,絕非偶然。

    對承啟而言,常年具備處理海量組學數(shù)據(jù)的能力,可以完全承擔建立neXtProt所需的服務器資源和技術(shù)資源,因此neXtProt亞洲分站的建設(shè)和運維都將由承啟負責。

    承啟承建人類蛋白質(zhì)組計劃官方數(shù)據(jù)庫neXtProt的亞洲分站,標志著中國在人類蛋白質(zhì)組計劃中的核心地位提升,這是承啟為推動人類蛋白質(zhì)組計劃進展、為中國和亞洲的蛋白質(zhì)科學發(fā)展的又一貢獻。

     
    消息來源:深圳承啟生物科技有限公司
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